Preview

Бюллетень сибирской медицины

Расширенный поиск

Возможности применения протеомного анализа в инфектологии

https://doi.org/10.20538/1682-0363-2019-2-248-261

Полный текст:

Аннотация

Современные методы диагностики и лечения инфекционных заболеваний должны базироваться на достоверных данных, полученных с помощью различных методов лабораторных исследований. Основными характеристиками, предъявляемыми к используемым методам, являются высокая чувствительность (возможность анализа малого количества образца, 10–6–10–4 г/мл), избирательность (селективность), воспроизводимость и др. Протеомные методы исследований удовлетворяют всем принципам доказательной медицины. Преимущества использования указанных методов для выявления маркеров (выявление белков с измененным уровнем экспрессии), своевременной диагностики и лечения инфекционных заболеваний, описанные в статье, очевидны, их внедрение в практическую деятельность врачей – элемент персонализированной медицины.

Об авторах

Н. С. Страшникова
Красноярская межрайонная детская больница № 1
Россия

Страшникова Наталья Сергеевна, врач-инфекционист

660111, г. Красноярск, ул. Тельмана, 49


Г. П. Мартынова
Красноярский государственный медицинский университет (КрасГМУ) имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого
Россия
Мартынова Галина Петровна, д-р мед. наук, профессор, зав. кафедрой детских инфекционных болезней с курсом

660022, г. Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1


А. Б. Салмина
Красноярский государственный медицинский университет (КрасГМУ) имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого
Россия
Салмина Алла Борисовна, д-р мед. наук, профессор, проректор по инновационному развитию и международной деятельности, зав. кафедрой биологической химии с курсом медицинской, фармацевтической и токсикологической химии, руководитель НИИ молекулярной медицины и патобиохимии

660022, г. Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1


Р. Я. Оловянникова
Красноярский государственный медицинский университет (КрасГМУ) имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого
Россия
Оловянникова Раиса Яковлевна, канд. биол. наук, доцент, кафедра биологической химии с курсом медицинской, фармацевтической и токсикологической химии

660022, г. Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1


В. А. Кутяков
Красноярский государственный медицинский университет (КрасГМУ) имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого
Россия
Кутяков Виктор Андреевич, канд. биол. наук, ст. преподаватель, кафедра биологической химии с курсом медицинской, фармацевтической и токсикологической химии

660022, г. Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1


А. Тохидпур
Красноярский государственный медицинский университет (КрасГМУ) имени профессора В.Ф. Войно-Ясенецкого
Россия
Тохидпур Аболхасем, ст. науч. сотрудник, НИИ молекулярной медицины и патобиохимии

660022, г. Красноярск, ул. Партизана Железняка, 1


Список литературы

1. Иванисенко В.А., Афонников Д.А., Николаев С.В., Пинтус С.С., Крестьянова М.А., Пальянов, А.Ю., Титов И.И. Актуальные проблемы компьютерной протеомики. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2005; 9 (2): 162–178.

2. Демидов Е.А., Пельтек С.Е. Протеомика. Вавиловский журнал генетики и селекции. 2014. 18 (1): 166–174.

3. Мирошниченко И.И., Птицина С.Н. Биомаркеры в современной медико-биологической практике. Биомедицинская химия. 2009; 55 (4): 425–440.

4. Копылов А.Т., Çгода В.Г. Количественные методы в протеомике. Биомедицинская химия. 2007; 53 (6): 613–643.

5. Beltran P.M J. et al. Proteomics and integrative omics approaches for understanding host-pathogen interactions and infectious diseases. Molecular Systens Biology. 2017; 13 (3): 922. DOI: 10.15252/msb.20167062.

6. Краснов Н.В., Лютвинский Я.И., Подольская Е.П. Масс-спектрометрия с мягкими методами ионизации в протеомном анализе. Научное приборостроение. 2010; 20 (4): 5–20.

7. Писарев Д.И., Новиков О.О., Васильев Г.В., Селютин О.А. Опыт использования метода MALDI/TOF/MS в фармацевтическом анализе. Научные ведомости Белгородского государственного университета. Серия:Медицина. Фармация. 2012; 18 (10–2): 76–85.

8. Медведев Ю.В., Раменская Г.В., Шохин И.Е., Ярушок Т.А. ВЖЭХ и СВЖХ как методы для определения лекарственных веществ в крови (обзор). Химико-фармацевтический журнал. 2013; 47 (4): 45–51.

9. Иванов А.С., Çгода В.Г., Арчаков А.И. Технологии белковой интерактомики. Биоорганическая химия. 2011. 37 (1): 8–21.

10. Говорун В.М., Иванов В.Т. Протеомика и пептидомика в фундаментальных и прикладных медицинских исследованиях. Биоорганическая химия. 2011; 37 (2):199–215.

11. Алексеева Л.А., Скрипченко Н.В., Бессонова Т.В. Диагностическое значение белков острой фазы в цереброспинальной жидкости детей с нейроинфекционными заболеваниями. Журнал инфектологии. 2010. 2 (2): 28–34.

12. Молотилова Т.Н. Сравнительная оценка биохимических характеристик спинномозговой жидкости и крови у больных менингитами различной этиологии: автореф. дис. ... канд. мед. наук. М., 2012: 121

13. Яшин Я.И., Яшин А.Я. Определение биомаркеров заболеваний хроматографическими методами. Медицинский алфавит. 2008; 4 (17): 32–34.

14. Осипов Г.А., Çыбина Н.Н., Родионов Г. Г. Опыт применения масс-спектрометрии микробных маркеров в лабораторной диагностике. Медицинский алфавит. 2013; 1 (3): 64–67.

15. Kovalyov L.I., Kovalyova M.A., Burakova M.V. et al. Studies of the pathogenesis of slow neuroinfections using proteomic techniques. Neurochemical Journal. 2007; 1 (4): 318–325.

16. Смирнова Н.И., Агафонов Д.А., Щелканова Е.Ю., Çаднова С.П., Черкасов А.В., Кутырев В.В. Геноварианты возбудителя холеры Эль Тор: получение, молекулярно-генетический и протеомный анализ. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2014; 1: 21–31.

17. Струкова Е.Г., Ефремов А.А., Гонтова А.А., Осипов Г.А., Сарматова Н.И. Определение микроэкологического статуса и диагностика инфекций организма человека с использованием метода хромато-масс-спектрометрии. Журнал Сибирского федерального университета. Серия: Химия. 2009; 2 (4):351–358.

18. Sahu A., Kumar S., Sreenivasamurthy S.K. et al. Host response profile of human brain proteome in toxoplasma encephalitis co-infected with HIV. Clinical Proteomics. 2014; 11 (1): 39. DOI: 10.1186/1559-0275-11-39.

19. Vu K., Eigenheer R.A., Phinney B.S., Gelli A. Cryptococcus neoformans promotes its transmigration into the central nervous system by inducing molecular and cellular changes in brain endothelial cells. Infection and Immunity. 2013; 81 (9): 3139–3147. DOI: 10.1128/IAI.00554-13.

20. Kroeker A.L., Ezzati P., Halayko A.J., Coombs K.M. Response of primary human airway epithelial cells to influenza infection: a quantitative proteomic study. Journal of Proteome Research. 2012; 11 (8): 4132–4146. DOI:10.1021/pr300239r.

21. Чеботарь И.В., Пономаренко О.А., Лазарева А.В., Карасева О.В., Горелик А.Л., Бочарова Ю.А., Тепаев Р.Ф. Использование MALDI-TOF-технологии для идентификации возбудителей септических состояний в педиатрической практике. Современные технологии в медицине. 2015. 7 (2): 68–74.

22. Sengupta N., Ghosh S., Vasaikar S.V., Gomes J., Basu A. Modulation of neuronal proteome profile in response to Japanese Encephalitis virus infection. PLoS One. 2014; 9 (3): e90211. DOI: 10.1371/journal.pone.0090211.

23. Кононихин А.С., Федорченко К.Ю., Рябоконь А.М., Стародубцева Н.Л., Попов И.А., Çавьялова М.Г., Анаев Э.Х., Чучалин А.Г., Варфоломеев С.Д., Николаев Е.Н. Протеомный анализ конденсата выдыхаемого воздуха в целях диагностики патологий дыхательной системы. Биомедицинская химия. 2015. 61 (6): 777–780.

24. Букин Ю.С., Джиоев Ю.П., Козлова И.В., Ружек Д., Çлобин В.И. Сравнительный анализ физико-химических свойств аминокислотных остатков, входящих в различные варианты оболочечного белка Е вируса клещевого энцефалита. Бюллетень ВСНЦ СО РАМН. 2014; 6 (100): 84–88.

25. Pérez-Llarena F.J., Bou G. Proteomics as a tool for studying bacterial virulence and antimicrobial resistance.Frontiers in Microbiology. 2016; 7: 410. DOI: 10.3389/fmicb.2016.00410.

26. Vranakis I., Goniotakis I., Psaroulaki A., Sandalakis V., Tselentis Y., Gevaert K., Tsiotis G. Proteome studies of bacterial antibiotic resistance mechanisms. Journal of Proteomics. 2014; (97): 88–99. DOI: 10.1016/j.jprot.2013.10.027.

27. Chen B., Zhang D., Wang X. et al. Proteomics progresses in microbial physiology and clinical antimicrobial therapy. European Journal of Clinical Microbiology & Infectious Diseases. 2016; 36 (3): 403–413. DOI: 10.1007/s10096-016-2816-4.

28. Румбешт В.В., Мационис А.Э., Дюжиков А.А., Сарвилина И.В. Иммунопротеомика инфекционного эндокардита нативных клапанов сердца. Медицинская иммунология. 2008; 10 (1): 27–34.

29. Douam F., Ploss A. Proteomic approaches to analyzing hepatitis C virus biology. Proteomics. 2015; 15 (12): 2051–2065. DOI: 10.1002/pmic.201500009.

30. Venugopal A.K., Ghantasala S.S.K., Selvan L.D.N. et al. Quantitative proteomics for identifying biomarkers for rabies. Clinical Proteomics. 2013; 10 (1): 3. DOI:10.1186/1559-0275-10-3.

31. Осипов Г.А., Родионов Г.Г. Применение метода массспектрометрии микробных маркеров в клинической практике. Поликлиника. 2013; (1–3): 68–73.

32. Способ диагностики аксонально-демиелинизирующих полиневропатий: пат. 2441240 Рос. Федерация: МПК G 01 N 33/49, G 01 N 27/62 / Ющук Н.Д. и др.; заявитель и патентообладатель Москва, Государственное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Московский государственный медико-стоматологический университет» Министерства здравоохранения и социального развития Российской Федерации – № 2010140643/15; заявл. 05.10.2010; опубл. 27.01.2012. Бюл. № 3.

33. Способ диагностики сифилиса с использованием метода прямого протеомного профилирования сыворотки крови: пат. 2381505 Рос. Федерация: МПК G 01 N 33/48 / Кубанова А.А. и др.; заявитель и патентообладатель Федеральное государственное учреждение «Государственный научный центр дерматовенерологии Федерального агентства по высокотехнологичной медицинской помощи» – № 2008138741/15,;заявл. 30.09.2008; опубл. 10.02.2010. Бюл. № 4.

34. Pendyala G., Trauger S.A., Kalisiak E., Ellis R.J., Siuzdak G., Fox H.S. Cerebrospinal fluid proteomics reveals potential pathogenic changes in the brains of SIV-infected monkeys. Journal of Proteome Research. 2009; 8 (5): 2253–2260. DOI: 10.1021/pr800854t.

35. Han M.-J., Lee S.Y. The Escherichia coli proteome: past, present, and future prospects. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 2006; 70 (2): 362–439. DOI: 10.1128/MMBR.00036-05.


Для цитирования:


Страшникова Н.С., Мартынова Г.П., Салмина А.Б., Оловянникова Р.Я., Кутяков В.А., Тохидпур А. Возможности применения протеомного анализа в инфектологии. Бюллетень сибирской медицины. 2019;18(2):248-261. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2019-2-248-261

For citation:


Strashnikova N.S., Martynova G.P., Salmina A.B., Olovyannikova R.Y., Kutyakov V.A., Tohidpur A. Possibilities of using proteomic analysis in infectiology. Bulletin of Siberian Medicine. 2019;18(2):248-261. (In Russ.) https://doi.org/10.20538/1682-0363-2019-2-248-261

Просмотров: 12


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1682-0363 (Print)
ISSN 1819-3684 (Online)