Preview

Бюллетень сибирской медицины

Расширенный поиск

ВАЛИДАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ ШИРОКОГЕНОМНОГО ИССЛЕДОВАНИЯ СВЯЗИ ПОЛИМОРФНЫХ ЛОКУСОВ С ПОВЫШЕННОЙ ЧАСТОТОЙ МАРКЕРОВ РАДИАЦИОННОГО ВОЗДЕЙСТВИЯ

https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-3-70-79

Полный текст:

Аннотация

Представлены результаты исследования по выборочной валидации, на большой независимой выборке связи генетических полиморфизмов с повышенной частотой хромосомных аберраций. Эти полиморфизмы ранее были индентифицированы в ходе собственных широкогеномных микрочиповых исследований, они показали связь повышенной частотой дицентриков и кольцевых хромосом, индуцируемых радиационным воздействием. Исследование проводилось на выборке работников Сибирского химического комбината (г. Северск) (n = 573), подвергавшихся радиационному воздействию в дозе от 40 до 400 мЗв. Связь с повышенной частотой дицентриков и (или) кольцевых хромосом была подтверждена для пяти полиморфных локусов из шести обследованных: INSR rs1051690 – гена инсулинового рецептора, PCTP rs2114443 – гена белка-переносчика фосфатидилхолина, VCAM1 rs1041163–генасиалогликопротеинамембраныэндотелиальныхклеток,TNKS rs7462102– гена танкиразы, WRN rs1800389 – гена синдрома Вернера. Полиморфизм гена инсулиноподобного фактора роста 1 (IGF1 rs2373721) не подтвердил связь с повышенной частотой маркеров радиационного воздействия.

Об авторах

М. В. Халюзова
Северский биофизический научный центр ФМБА России, Северск; Национальный исследовательский Томский государственный университет, Томск
Россия
Халюзова Мария Вячеславовна, младший научныйсотрудник лаборатории геномной медицины Северского биофизического научного центра ФМБА России, аспирант кафедры физиологии человека и животных НИ ТГУ


Н. В. Литвяков
Северский биофизический научный центр ФМБА России, Северск, Научно-исследовательский институт онкологии Сибирского отделения РАМН, Томск, Национальный исследовательский Томский государственный университет, Томск
Россия
Литвяков Николай Васильевич, канд. биологическихнаук, старший начный сотрудниклаборатории молекулярной онкологии и иммунологии Научно-исследовательский институт онкологии Сибирского отделения РАМН; старший начный сотрудниклаборатории геномной медицины Северского биофизического научного центра ФМБА России, доцент кафедры физиологии человека и животных НИ ТГУ


А. Э. Сазонов
Северский биофизический научный центр ФМБА России, Северск, Сибирский государственный медицинский университет, Томск
Россия
Сазонов Алексей Эдуардович, доктор медицинских нак, зам. заведующего Центральной научно-исследовательской лаборатории СибГМУ;  руководитель лаборатории геномной медицины Северского биофизического научного центра ФМБА России


Е. Н. Альбах
Северский биофизический научный центр ФМБА России, Северск
Россия
Альбах Елена Николаевна, младший научныйсотрудник лаборатории геномной медицины Северского биофизического научного центра ФМБА России


Д. С. Исубакова
Северский биофизический научный центр ФМБА России, Северск
Россия
Исубакова Дарья Сергеевна, младший научныйсотрудник лаборатории геномной медицины Северского биофизического научного центра ФМБА России


А. Б. Карпов
Карпов Андрей Борисович, доктор медицинских наук, профессор, зам. директора Северского биофизического научного центра ФМБА России; профессор кафедры организации здравоохранения и общественного здоровья СибГМУ
Россия
Северский биофизический научный центр ФМБА России, Северск, Сибирский государственный медицинский университет, Томск


Р. М. Тахауов
Северский биофизический научный центр ФМБА России, Северск; Сибирский государственный медицинский университет, Томск
Россия
Тахауов Равиль Манихович, доктор медицинских нак, профессор, директор Северского биофизического научного центра ФМБА России; профессор кафедры организации здравоохранения и общественного здоровья СибГМУ


Список литературы

1. Литвяков Н.В., Гончарик О.О., Фрейдин М.Б., Сазонов А.Э., Васильева Е.О., Межерицкий С.А., Халюзова М.В., Бондарюк А.А., Альбах Е.Н., Карпов А.Б., Тахауов Р.М. Оценка связи полиморфизмов генов с частотой и спектром цитогенетических аномалий у здоровых работников Сибирского химического комбината, подвергавшихся радиационному воздействию (microarray исследования) // Радиационная биология. Радиоэкология. 2013. Т. 53, № 2. С. 1–14.

2. Литвяков Н.В., Фрейдин М.Б., Тахауов Р.М., Агеева А.М., Волкова Н.В., Иванина П.В., Гончарик О.О., Васильева О.Е., Скобельская Е.В., Карпов А.Б. Взаимосвязь генного полиморфизма с риском развития злокачественных новообразований в условиях низкоинтенсивного радиационного воздействия // Экологическая генетика. 2009. Т. VII, № 4. С. 23–33.

3. Litviakov N.V., Denisov E.V., Takhauov R.M., Karpov A.B., Skobel’skaja E.V., Vasil’eva E.O., Goncharik O.O., Ageeva A.M., Mamonova N.V., Mezheritskiy S.A., Sevost’janova N.V., Koshel A.P. Association Between TP53 Gene ARG72PRO Polymorphism and Chromosome Aberrationsin Human Cancers // Molecular Carcinogenesis. 2010. 49. P. 521–524.

4. Литвяков Н.В., Тахауов Р.М., Васильева Е.О., Мамонова Н.В., Скобельская Е.В., Карпов А.Б. Возможности совершенствования системы охраны здоровья персонала предприятий атомной индустрии // Здравоохранение РФ. 2010. № 6. С. 19–23.

5. Abilev S.K., Sal'nikova L.E., Rubanovich A.V. Candidate gene association study of the radiosensitivity of human chromosomes with candidate gene polymorphisms upon exposure to gamma-irradiation in vitro and in vitro // National Center for Biotechnology Information. 2011. № 5. P. 14–18.

6. Васильева З.Ж., Берсимбаев Р.И., Бекманов Б.О., Воробцова И.Е. Полиморфизм генов репарации ДНК XRCC1, XRCC3 и уровень хромосомных аберраций у рабочих уранового производства // Радиационная биология. Радиоэкология. 2012. Т. 52, № 1. С. 25.

7. Сальникова Л.Е., Чумаченко А.Г., Веснина И.Н. Полиморфизм генов репарации: цитогенетические эффекты облучения // Радиационная биология. Радиоэкология. 2010. Т. 50, № 6. С. 29–38.

8. Bonassi S., Znaor A., Norppa H., Hagmar L. Chromosomal aberrations and risk of cancer in humans: an epidemiological perspective // Cytogenet. Genome Res. 2004. V. 104. P. 376–382.

9. Catalán J., Heilimo I., Falck G.C. Chromosomal aberrations in railroad transit workers: effect of genetic polymorphisms // Environ. Mol. Mutagen. 2009. V. 50, № 4. P. 304–316.

10. Rossi A.M., Hansteen I.L., Skjelbred C.F. Association bet-ween frequency of chromosomal aberrations and cancer risk is not influenced by genetic polymorphisms in GSTM1 and GSTT1 // Environ. Health Perspect. 2009. V. 117. № 2. P. 203–208.

11. Salnikova L., Chumachenko A., Belopolskaya O., Rubanovich A. Correlations between DNA polymorphism and frequencies of gamma-radiation induced and spontaneous cytogenetic damage. National Center for Biotechnology Information // 2012. V. 103, № 1. P. 37–41.

12. Ребриков Д.В., Саматов Г.А., Трофимов Д.Ю. ПЦР «в реальном времени» / под ред. д-ра биологическихнаук Д.В. Ребрикова. 2-е изд., испр. и доп. М.: БИНОМ. Лаборатория знаний, 2009. 223 с.

13. Макарова Ю.А., Крамеров Д.А. Некодирующие РНК // Биохимия. 2007. Т. 72, № 11. С. 1427–1448.

14. Landi D., Moreno V., Guino E. Polymorphisms affecting micro-RNA regulation and associated with the risk of dietary-related cancers: A review from the literature and new evidence for a functional role of rs17281995 (CD86) and rs1051690 (INSR), previously associated with colorectal cancer // Mutation Research. 2011. V. 717. P. 109–115.

15. Landi D., Gemignani F., Naccarati A. Polymorphisms within micro-RNA-binding sites and risk of sporadic colorectal cancer // Carcinogenesis. 2008. V. 29. P. 579–584.

16. Palmero E.I., Campos S.G., Marcelo Campos M. Mechanisms and role of microRNA deregulation in cancer onset and progression // Genetics and Molecular Biology. 2011. V. 34, № 3. P 363–370.

17. Pelletier C., Weidhaas J.B. MicroRNA binding site polymorphisms as biomarkers of cancer risk. Expert Review of Molecular Diagnostics // 2010. V. 10, № 6. P. 817–829.

18. Dey B.R., Furlanetto R.W., Nissley S.P. Cloning of human p55-gamma, a regulatory subunit of phosphatidylinositol 3-kinase, by a yeast two-hybrid library screen with the insulin-like growth factor-I receptor // Gene. 1998. P. 175–183.

19. Ebina Y., Ellis L., Jarnagin K., Edery M., Graf L., Clauser E., Ou J.-H., Masiarz F., Kan Y.W., Goldfine I.D., Roth R.A., Rutter W.J. The human insulin receptor cDNA: the structural basis for hormone activated transmembrane signalling // Cell. 1985. V. 40. P. 747–758.

20. Wu M.K., Boylan M.O., Cohen E.D. Cloning and gene structure of rat phosphatidylcholine transfer protein, Pctp // Gene. 1999. V. 235. P. 111–120.

21. Kanno K., Wu M.K., Agate D.S. Interacting Proteins Dictate Function of the Minimal START Domain Phosphatidylcholine Transfer Protein/StarD2 // J. Biological chemistry. 2007. V. 282, № 42. P. 30728–30736.

22. Kanno K., Wu M.K., Scapa E.F. Structure and function of phosphatidylcholine transfer protein (PC-TP)/StarD2 // Biochimica et Biophysica Acta. 2007. P. 654–662.

23. Tilley S.J., Skippen A., Murray-Rust J. Structure-Function Analysis of Phosphatidylinositol Transfer Protein Alpha Bound to Human Phosphatidylinositol // Structure. 2004. V. 12. P. 317–326.

24. Kang H.W., Ribich S., Kim B.W. Mice lacking Pctp/StarD2 exhibit increased adaptive thermogenesis and enlarged mitochondria in brown adipose tissue // J. of Lipid Research. 2009. V. 50. P. 2212–2221.

25. Nicolay K., Hovius R., Bron R. et al. The phosphatidylcholine-transferprotein catalyzed import of phosphatidylcholine into isolated rat liver mitochondria // BBA – Biomembranes. 1990. V. 1025, № 1. P. 49–59.

26. Feng B., Yao P.M., Li Y., Devlin C.M. The endoplasmic reticulum is the site of cholesterol-induced cytotoxicity in macrophages // Nat. Cell Biol. 2003. V. 5. P. 781–792.

27. Woods K.A., Camacho-Hubner C., Savage M.O., Clark A.J.L. Intrauterine growth retardation and postnatal growth failure associated with deletion of the insulin-like growth factor I gene // New Eng. J. Med. 1996. V. 335. P. 1363–1367.

28. Garmy-Susini B., Jin H., Zhu Y., Sung R.-J., Hwang R., Varner J. Integrin alpha-4-beta-1-VCAM-1-mediated adhesion between endothelial and mural cells is required for blood vessel maturation // J. Clin. Invest. 2005. V. 115. P. 1542–1551.

29. Supanc V., Biloglav Z., Kes V.B., Demarin V. Role of cell adhesion molecules in acute ischemic stroke // Ann Saudi Med. 2011. V. 31, № 4. P. 365–70.

30. Nishihira S., Okubo N., Takahashi N., Ishisaki A. High-cell density-induced VCAM1 expression inhibits the migratory ability of mesenchymal stem cells // Cell Biology International. 2011. V. 35. P. 475–481.

31. Zhang H., Yang M.H., Zhao J.J., Chen L., Yu S.T., Tang X.D., Fang D.C., Yang S.M. Inhibition of tankyrase 1 in human gastric cancer cells enhances telomere shortening by telomerase inhibitors // Oncol. Rep. 2010. V. 24, № 4. P. 1059–65.

32. Seimiya H., Smith S. The telomeric poly(ADP-ribose) polymerase, tankyrase 1, contains multiple binding sites for telomeric repeat binding factor 1 (TRF1) and a novel acceptor, 182-kDa tankyrase-binding protein (TAB182) // J. Biol. Chem. 2002. V. 277. P. 14116–14126.

33. Smith S., Giriat I., Schmitt A., de Lange T. Tankyrase, a poly (ADP-ribose) polymerase at human telomeres // Science. 1998. V. 282. P. 1484–1487.

34. Cook B.D., Dynek J.N., Chang W., Shostak G., Smith S. Role for the Related Poly (ADP-Ribose) Polymerases Tankyrase 1 and 2 at Human Telomeres // Mol. Cell. Biol. 2002. V. 22. P. 1332–342.

35. Liu J., Song Y., Qian J. Promyelocytic leukemia protein interacts with werner syndrome helicase and regulates double-strand break repair in γ-irradiation-induced DNA damage responses // Biochemistry. 2011. V. 76, № 5. P. 550–554.

36. Baker J., Liu J.-P., Robertson E.J., Efstratiadis A. Role of insulin-like growth factors in embryonic and postnatal growth // Cell 75: 73–82, 1993.

37. Playford M.P., Bicknell D., Bodmer W.F., Macaulay V.M. Insulin-like growth factor 1 regulates the location, stability, and transcriptional activity of beta-catenin // Proc. Nat. Acad. Sci. 2000. 97. Р. 12103–12108.


Для цитирования:


Халюзова М.В., Литвяков Н.В., Сазонов А.Э., Альбах Е.Н., Исубакова Д.С., Карпов А.Б., Тахауов Р.М. ВАЛИДАЦИЯ РЕЗУЛЬТАТОВ ШИРОКОГЕНОМНОГО ИССЛЕДОВАНИЯ СВЯЗИ ПОЛИМОРФНЫХ ЛОКУСОВ С ПОВЫШЕННОЙ ЧАСТОТОЙ МАРКЕРОВ РАДИАЦИОННОГО ВОЗДЕЙСТВИЯ. Бюллетень сибирской медицины. 2014;13(3):70-79. https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-3-70-79

For citation:


Khalyuzova M.V., Litvyakov N.V., Sazonov A.E., Albakh Y.N., Isubakova D.S., Karpov A.B., Takhauov R.M. THE VALIDATION OF THE RESULTS OF MICROARRAY STUDIES OF ASSOCIATION BETWEEN GENE POLYMORPHISMS AND THE FREQUENCY OF RADIATION EXPOSURE MARKERS. Bulletin of Siberian Medicine. 2014;13(3):70-79. (In Russ.) https://doi.org/10.20538/1682-0363-2014-3-70-79

Просмотров: 341


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 4.0 License.


ISSN 1682-0363 (Print)
ISSN 1819-3684 (Online)